食源性疾病不容小觑 基因组测序技术助力病情识别
炎炎夏日，气温不断升高，为细菌增殖创造了条件，食物更容易腐烂变质，各种肠道传染病和食物中毒也在夏季频频发生。 这些均属于食源性疾病，食源性疾病分为三种：食物感染、食物中毒、中毒染；食源性疾病与食用某种食物有关，多为集体暴发。食源性疾病的典型症状包括：恶心、呕吐、胃痉挛、腹泻、发烧等。 目前，食源性疾病的发病率在世界总发病率中位居前列，成为中国以及世界上主要的的卫生问题。世界卫生组织认为，凡是通过食物进入的各种致病因子引起的，具有感染性或中毒性的疾病，都是食源性疾病。也就是说，利用食物传播的方式导致病原体进入并引起的中毒或感染性疾病都叫食源性疾病。 沙门氏菌、弯曲杆菌和肠出血性大肠杆菌属于最常见的食源性病原体，每年影响数百万人，有时导致严重和致命后果。症状是发烧、头痛、恶心、呕吐、腹痛和腹泻。沙门氏菌疫情涉及的食物包括蛋类、家禽和动物源产品。感染弯曲杆菌的食源性病例主要是由原料奶、生的或未煮熟的家禽以及饮用水所导致。肠出血性大肠杆菌与未经消毒的牛奶、未做熟的肉类以及新鲜水果和蔬菜有关。此外，还有李斯特菌、霍乱孤菌都是常见的食源性病原体。 对于这一类食源性疾病，抗生素对其治疗至关重要。但是，兽医和人类医学中过度用和滥用这类药物与耐药性细菌的出现和传播相关，致使对动物和人类的传染病治疗无效。 随着生命科学的研究进程加快，专家发现随着新一代基因组测序技术的发展，基于全基因组测序(WGS)的分子分型技术在食源性疾病聚集性病例识别和爆发溯源调查中显示出极大的应用价值和发展潜力。 在食品安全领域，越来越多的研究机构和监管部门将全基因组测序技术应用于食源性疾病疫情爆发的识别和监测, 并基于此技术进行疾病溯源追踪和污染调查等。基于全基因组测序的分型技术不仅可以快速检测病原菌, 而且具有较高的准确度和分辨率。 我国搭建了全基因组数据计算云引擎，将标准化的WGS数据分析流程转移到云端，大大降低了WGS数据分析、运算及使用门槛。还开发了常见食源性致病菌毒力因子、耐药基因、血清分子分型、wgMLST分析、wgSNP等自动化分析功能模块，有助于各级实验室开展食源性微生物遗传与变异特征、致病和耐药机制及菌株进化等方面的基础研究。 食源性疾病的研究任重而道远，尽管科学在进步但仍然有很多疑难问题亟待解决，我们相信随着社会的发展，科研的深入，这些问题终将会被一一攻克。
